Tutorial experimental para determinação da estrutura tridimensional da enzima adenosina deaminase de Edwardsiella tarda por modelagem comparativa
Abstract
A Edwardsiella tarda é responsável pela edwardsielose. O tratamento da edwardisielose não é totalmente eficaz e nenhuma vacina comercial está disponível no mercado. Nesse sentido, o conhecimento dos processos bioquímicos da E. tarda é importante para a determinação de moléculas alvo, sobretudo de proteínas, para o tratamento ou eliminação da bactéria. Uma das proteínas capitais de E. tarda é a adenosina deaminase (EtAD), responsável pela deaminação da adenosina em inosina no processo de maturação do RNA transportador. Mesmo apresentando grande importância biológica em E. tarda, nenhum estudo relacionado à EtAD. Diante desse cenário, o objetivo desse trabalho é de gerar a estrutura tridimensional EtAD, bem como, oferecer ao leitor um tutorial facilitado sobre o uso do Modeller, o principal software de modelagem comparativa. Após a modelagem, verificou-se que as estruturas de EtAD e EcAD (adenosina deaminase de Escherichia coli) compartilham o mesmo padrão de enovelamento. A semelhança estrutural se deve ao percentual de resíduos compartilhados entre as duas proteínas, em torno de 77%. O emprego da modelagem molecular de proteínas pode auxiliar na escolha de novos alvos terapêuticos em potencial. Ademais, este trabalho fornece ao leitor uma fácil e compreensível introdução sobre o processo de modelagem comparativa.
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